São Francisco Borja

São Francisco Borja foi o primeiro povo a ser fundado no segundo ciclo.
Fazia parte dos Sete Povos das Missões.
No ano de 1682 ocorreu a fundação do povoado, no início era apenas uma colônia do povo de São Tomé, com cerca de 1952 pessoas. Aos poucos mais nativos vieram da Banda Ocidental e formaram uma nova redução em 1687, o Padre que os orientou e fundou São Francisco Borja foi Francisco Garcia.
A construção da igreja e de outras obras, foi projetada e orientada pelo irmão José Brazanelli. Este, também treinou e comandou os índios em vários combates contra a Colônia de Sacramento e a confederação dos guenoas, os nativos papeanos que eram instigados pelos portugueses a lutar contra os Guaranis.
A redução de São Francisco Borja desapareceu pelo mesmo motivo que os outros seis povos missioneiros. Nada resta de seus templos e casas.
A cidade de São Borja, foi erguida sobre o sítio Arqueológico.